Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms