Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21060J3KMU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms