Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms