Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21897J3KMP5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21897J3KMP5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms