Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms