Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r67G5E8C1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms