Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdelc2G5E897 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdelc2G5E897 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms