Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl3l2G3X992 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms