Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms