Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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