Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl9F7BE40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl9F7BE40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms