Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10563F6WIE4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms