Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms