Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28305F6U473 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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