Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc6F2Z461 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms