Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Usp31E9Q6Y8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp31E9Q6Y8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Usp31E9Q6Y8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Usp31E9Q6Y8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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