Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms