Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms