Protein–RNA interactions for Protein: E9Q365

Vmn1r101, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r101E9Q365 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r101E9Q365 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms