Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf11E9PZM7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf11E9PZM7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms