Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn4E9PX29 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms