Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms