Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp944E9PUS4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp944E9PUS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms