Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Galntl6E5D8G1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Galntl6E5D8G1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms