Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna7C0LLJ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms