Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfap1aC0HKD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfap1aC0HKD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms