Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms