Protein–RNA interactions for Protein: B2RXE2

Slc9a5, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a5B2RXE2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a5B2RXE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a5B2RXE2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms