Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud4B2RRE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms