Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H60cB1B213 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms