Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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