Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm13178B1AVU7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm13178B1AVU7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms