Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms