Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms