Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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