Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc4a11A2AJN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms