Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdc27A2A6Q5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdc27A2A6Q5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms