Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms