Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms