Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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