Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms