Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn6Q9Z262 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms