Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim35Q8C006 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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