Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Eri2-207ENSMUST00000150844 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Hp1bp3-203ENSMUST00000105825 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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