Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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