Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms