Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Trim39Q9ESN2 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim39Q9ESN2 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim39Q9ESN2 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim39Q9ESN2 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim39Q9ESN2 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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