Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtpreP49446 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtpreP49446 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtpreP49446 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtpreP49446 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtpreP49446 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtpreP49446 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtpreP49446 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtpreP49446 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtpreP49446 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtpreP49446 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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