Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Rnf19a-201ENSMUST00000022890 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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