Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Stxbp5l-205ENSMUST00000114782 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Enox2-205ENSMUST00000114918 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vps8-201ENSMUST00000096191 4952 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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